Od początku ubiegłego roku trwały intensywne prace przygotowawcze obejmujące wykonanie projektu modernizacji stacji oraz uzyskanie decyzji środowiskowej dla projektu. W styczniu 2011 rozpoczęto postępowanie przetargowe, którego efektem finalnym było wyłonienie generalnego wykonawcy modernizacji SUW.
W zmodernizowanej stacji uzdatniania wody powstaną nowe węzły technologiczne wyposażone w instalacje: wstępnego uzdatniania wody, mikrofiltracji ciśnieniowej, demineralizacji wody, odwróconej osmozy dla obróbki wody zasolonej oraz oczyszczania ścieków technologicznych. Dotychczasowe urządzenia zastąpione zostaną nowoczesnymi i wysoce sprawnymi instalacjami, wykorzystującymi najnowsze technologie. Wydajność stacji będzie się kształtowała na poziomie 30 m3/h.
Modernizacja SUW przyczyni się między innymi do zmniejszenia nakładów finansowych związanych z produkcją wody zdemineralizowanej. Wpłynie na poprawę parametrów fizyko – chemicznych ścieków technologicznych oraz zwiększenie trwałości istniejących i nowych instalacji i urządzeń technologicznych wytwarzających energię elektryczną i ciepło w elektrociepłowni.
Modernizując instalację  pomyślano nie tylko o wprowadzeniu nowoczesnej technologii wytwarzania wody, ale także o zmniejszeniu jej wpływu na środowisko. Nowa stacja będzie posiadała nową oczyszczalnię ścieków technologicznych. Zmniejszenie wpływu na środowisko zostanie osiągnięte przez całkowitą rezygnację z wody wodociągowej, gdyż nowa technologia uzdatniania wody pozwoli na demineralizację wody powierzchniowej o zawartości chlorków do 1600 mg/l czyli wody morskiej w trakcie występowania tzw. „cofki” wód  Zalewu Wiślanego do rzeki Elbląg, mniejsze zużycie chemikaliów i likwidację źródeł emisji chlorowodoru jakim były cztery zbiorniki na kwas solny.